产品名称:Circleligase Ⅱ
中文名称:环状连接酶
产品编号与包装规格:
编号 | 产品名称 (点击名称进入下单页面) | 规格 | 产品介绍 | 价格 |
HKM027系列 | Circleligase Ⅱ | 10次 | 50次 | 热稳定性环状连接酶 | — |
HKM027-01A | Circleligase Ⅱ | 10次 | 960 | |
HKM027-01B | 环状连接酶 | 50次 | 4288 |
产品描述:Circleligase II 是一种热稳定性酶,可以在没有互补序列存在的情 况下催化具有 5'-磷酸基团和 3'-羟基基团的单链 DNA(ssDNA)/单 链 RNA (ssRNA)的自环化,该反应不依赖于 ATP。
产品特点:
◐可在标准反应条件下,高效催化长度为 15-200nt 的 ssDNA / ssRNA 发生链内环化;
◑可催化单链底物与 5'磷酸化/腺苷酸化的单链 DNA 接头连接。
产品用途:
1) 产生环状的单链 DNA 分子,用于滚环复制或者滚环转录的实 验研究。
2) 用于 cfDNA/ctDNA 测序,甲基化测序等。
检测方法:
1)连接产物经 20% 聚丙烯酰胺/8 M 尿素的 PAGE 胶检测,线 性 DNA 分子的迁移速度较环状 DNA 分子快。
2)加入核酸外切酶 I ( Exo I ),37℃反应 45min,线性 DNA 被 完全消化,而环状单链 DNA 分子不受外切酶的影响。Exonuclease I, 能够从 ssDNA 的 3'-OH 末端分解生成 5'-单核苷酸,对 ss DNA 具 有较高的特异性,不分解双链 DNA 及 RNA。
检测结果:
图:Circleligase II 连接结果检测(变性 PAGE 胶)
lane1:未经 Circleligase II 和外切酶处理的 70nt 线性单链 DNA;
lane2:Circleligase II 处理后的 70nt 单链 DNA 环化产物;
lane3:70nt 线性单链 DNA 环化产物经 Exo I 酶切处理结果;
保存温度:-20 ℃保存,或- 80℃长期保存。
Circleligase Ⅱ 产品包装:
产品组成 | A 包装 | B 包装 |
Circleligase Ⅱ (100U/μl) | 1000U | 5000U |
5×Circleligase Ⅱ Reaction Buffer | 100μl | 500μl |
50mM Mncl₂ | 20μl | 100μl |
ssDNA Control oligo(5pmol/μl) | 5μl | 5μl |
RNase free water | 500μl | 1ml×2 |
质量控制:所有组分经检测均无大肠杆菌 DNA 残留,无核酸 内/外切酶、磷酸酶以及 RNA 酶活性污染。
活性定义:60℃条件下,1 小时内催化 1pmol 的标准线性单 链寡核苷酸(70nt,5' 磷酸化)转换成抗核酸外切酶 I 消化的环状结构所需要的酶量定义为 1 个活性单位。
常用反应体系(20μl):
产品组成 | 体积 |
Circleligase Ⅱ (100U/μl) | 1μl |
5×Circleligase Ⅱ Reaction Buffer | 4μl |
50mM Mncl₂ | 1μl |
ssDNA | 1-10pmol |
RNase free water | To 20μl |
注: 1) ssDNA (15-200nt 环化效率较高)应含有 5'-磷酸基 团和 3'-羟基基团;
2)若实验有特殊需要,可缩短反应时间至 30min, 若为复杂模板,反应时间应适量延长或增加酶量。
反应条件:
1×反应缓冲液条件下,60℃温育 1h。
80℃,10 分钟热失活。
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