基于钙黄绿素的闭管LAMP技术检测生肉沙门氏菌
发布时间:2025-04-28 浏览次数:25 分享:
在食品安全备受关注的当下,肉类中的沙门氏菌污染问题成为公众焦点。据统计,全球每年因沙门氏菌感染导致9380万病例,15.5万人死亡,在菲律宾,它更是食物中毒爆发的主要微生物原因。传统检测方法耗时费力,新型分子检测技术应运而生,其中,一种基于钙黄绿素的封闭管环介导等温扩增(LAMP)检测方法脱颖而出,为肉类沙门氏菌检测带来新希望。
传统检测困境:耗时费力且昂贵
传统的细菌培养检测方法一直被视为检测沙门氏菌的“金标准”,但它需要经过一系列复杂的生化和血清学测试,整个过程至少需要6天,耗费大量人力、物力和时间。分子检测技术如常规PCR虽然能实现高通量检测且耗时较短,但需要昂贵的设备、试剂以及专业技术人员操作,成本高昂。血清学检测方法虽有快速、经济等优点,但易受批次差异、交叉反应影响,准确性欠佳。这些问题在发展中国家尤为突出,迫切需要一种更高效、低成本的检测方法。
LAMP技术
LAMP技术由Notomi等人在2000年开发,为沙门氏菌检测开辟了新途径。它使用4-6种独立引物和Bst DNA聚合酶,在60-65℃的恒定温度下就能进行核酸扩增,相比常规PCR,反应速度更快,能在短时间内产生大量产物。而且,LAMP检测可以在封闭管内完成,减少了开盖操作带来的污染风险,还能通过比色、荧光或浊度等可视化方式直接判断结果,操作简单便捷,特别适合小型实验室和现场检测。
LAMP检测优化:更灵敏、更精准
研究团队针对肉类样本,对基于钙黄绿素的封闭管LAMP检测方法进行了优化。在反应体系中,精确调整了钙黄绿素、MnCl2和MgSO4的浓度,最终确定为64μM、1mM和5mM,使检测结果在扩增后呈现出明显的颜色差异,阴性为橙色,阳性为绿色,便于肉眼观察。同时,添加甜菜碱有效减少了非特异性扩增,提高了检测的特异性。优化后的LAMP检测在65℃反应60分钟,后续可选择80℃处理2分钟使酶失活,整个流程高效且稳定。
性能远超常规PCR
经过一系列实验验证,优化后的LAMP检测展现出卓越性能。在特异性方面,对多种沙门氏菌血清型和非沙门氏菌菌株检测时,只有沙门氏菌菌株出现扩增反应,证明其引物特异性良好。在灵敏度上,更是优于常规PCR。对于DNA稀释系列,LAMP检测能检测到低至10−5稀释度的DNA,比常规PCR灵敏度高10倍;在纯细菌培养检测中,LAMP检测的最低检测限为4.8×103 CFU/mL,相比常规PCR的4.8×107 CFU/mL,灵敏度提升了1000倍。
图1 肠炎沙门氏菌(Salmonella enterica)DNA 系列稀释后的 LAMP 和 PCR 扩增结果。(A) LAMP 扩增产物,阴性管呈橙棕色,阳性结果呈黄绿色。(B - C) 使用 10,000× SYBR® Safe 核酸凝胶染色剂染色后,通过琼脂糖凝胶电泳观察 LAMP 和 PCR 产物。试管和泳道 1 - 8:肠炎沙门氏菌肠炎亚种肠炎血清型 ATCC 49223M 的 DNA 从初始浓度 347 ng/μL 开始,依次稀释至10−8 , 10−7 , 10−6 , 10−5 , 10−4 , 10−3 , 10−2 , 10−1。泳道 L 和 M 分别为 1 kb 和 100 bp 的 DNA 标志物。
在对341份生肉样本的平行检测中,当LAMP检测与常规培养富集方法结合时,对生鸡肉、牛肉和猪肉样本的检测阳性率均达到100%,与常规PCR检测结果相当,且显著高于3小时缩短富集方案与LAMP检测结合的阳性率。这表明优化后的LAMP检测在结合常规培养方法时,能更灵敏、准确地检测出肉类中的沙门氏菌。
图2. 对341份生鸡肉、牛肉和猪肉样本(n=341)进行检测时,3小时缩短富集结合闭管LAMP检测(3小时LAMP)、常规培养结合优化闭管LAMP检测(培养-LAMP)以及常规培养结合PCR检测(培养-PCR)的阳性率。
前景展望
这种优化后的LAMP检测方法为肉类沙门氏菌检测提供了一种强大的补充或替代手段,不仅灵敏度高、特异性强,而且操作简便、成本较低,适合在资源有限的环境中推广应用。未来,随着技术的进一步发展,有望缩短检测前处理时间,简化上游操作步骤,降低检测成本,为全球食品安全保障发挥更大作用。对于消费者来说,这意味着能更快、更准确地了解肉类食品安全状况,减少因食用受污染肉类而患病的风险,让餐桌更加安全。
参考文献:Balaga K B, Pavon R D N, Calayag A M B, et al. Development of a closed-tube, calcein-based loop-mediated isothermal amplification assay to detect Salmonella spp. in raw meat samples[J]. Journal of Microbiological Methods, 2024, 220: 106922.
来源:微生物安全与健康网,作者~蔡伟程。